<?php
error_reporting(-1);
$text = <<<EOF
Пocтaвкa мяco гoвядины, бecкостнoe для нужд государственного бюджетного учреждения здравоохранения Республики Башкортостан Инфекционная клиническая больница № 4 города Уфа 
EOF;

$regexp = "/([а-яё]*)([apocex]+)([а-яё]*)/ui";

$result = preg_replace($regexp, "$1[$2]$3", $text);

echo $result;