language: C# (mono-2.8)
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using System;
using System.Collections.Generic;
using System.Linq;
 
static class Program
{
        public static void Main(string[] args)
        {
            var list1 = new int?[] { 1, 2, 3, 4, 5 };
            var list2 = new int?[] { 3, 4, 5, 6, 7 };
            var list3 = new int?[] { 6, 9, 9 };
 
            var lockstep = LockStepSequences(new[] { list1, list2, list3 });
 
            foreach (var step in lockstep)
                Console.WriteLine(string.Join("\t", step.Select(i => i.HasValue ? i.Value.ToString() : "null").ToArray()));
        }
 
        public static IEnumerable<IEnumerable<T>> LockStepSequences<T>(this IEnumerable<IEnumerable<T>> sequences)
        {
            var iters = sequences
                .Select((s, index) => new { active=true, index, enumerator = s.GetEnumerator() })
                .ToArray();
 
            var isActive = iters.Select(it => it.enumerator.MoveNext()).ToArray();
            var numactive = isActive.Count(flag => flag);
 
            try
            {
                while (numactive > 0)
                {
                    T min = iters
                        .Where(it => isActive[it.index])
                        .Min(it => it.enumerator.Current);
 
                    var row = new T[iters.Count()];
 
                    for (int j = 0; j < isActive.Length; j++)
                    {
                        if (!isActive[j] || !Equals(iters[j].enumerator.Current, min)) 
                            continue;
 
                        row[j] = min;
                        if (!iters[j].enumerator.MoveNext())
                        {
                            isActive[j] = false;
                            numactive -= 1;
                        }
                    }
                    yield return row;
                }
            }
            finally
            {
                foreach (var iter in iters) iter.enumerator.Dispose();
            }
        }
}